◎ 事實摘要
OO國際股份有限公司，為了促進產業升級，提出之21項專案中，有許多不同類型之專案，如內、外接類比式數據機、寬頻數據機、網路卡、路由器、交換器、無線，符合促進產業升級條例。但國稅局逐一審視是否具備創新高度之要件，而非抽象泛論「僅從事既有標準化產品之成本降低或符合現有市面LAN CARD等之標準規格活動」云云，即認為OO國際股份有限公司所提專案不符創新高度而不准OO國際股份有限公司之申請，OO國際股份有限公司94年度營利事業所得稅結算申報，原列報研究與發展支出新臺幣（下同）28,992,873元及可抵減營利事業所得稅稅額8,697,862元，經國稅局均核定為0元，應補營利事業所得稅稅額9,118,223元。經最高行政法院將原判決廢棄，發回臺北高等行政法院重新審理。
◎ 勝訴關鍵
一、財政部為利下級機關進行公司研究發展及人才培訓支出之審查，定有生效日期93年10月26日之「公司研究與發展及人才培訓支出適用投資抵減辦法審查要點」（下稱93年審查要點），其就投資抵減辦法第2條第1項各款規定之費用，固有關於「應檢附之證明文件」之規範，然此等規定核屬關於證明文件之例示，即所規範之證明文件尚非所謂之法定證據，故不得以當事人已提出或未能提出審查要點規定之文件，即當然得謂符合或不合投資抵減費用之列報要件，而仍應就調查證據結果並斟酌全辯論意旨，為是否合致相關費用列報要件之事實認定。
二、本件關於項次15、16專案，OO國際股份有限公司有提出研發流程圖、研發人員名冊、產品企劃書、會議紀錄、公司組織圖、研發費傳票明細、領料紀錄、庫存過期明細、統一發票、支付憑證、財產目錄、會計傳票、統一發票、支付憑證、研發單位建築物折舊費明細、研發全職人員薪資表、各項次開始日期及新技術說明、研發團隊等證據一節，業經原判決認定在案；而系爭項次15、16專案曾經原審送請經濟部工業局鑑定，並經工業局101年3月30日函稱：「……二、本案經查旨揭公司所提示之『研究與發展計畫』內容，核項次15『DVB-T TV Tuner Card』及項次16『DVB-T USB2.0 Receiver』研究與發展內容，……應亦符合促進產業升級條例第6條第2項租稅獎勵（創新研發）之範疇。」，顯見OO國際股份有限公司已提示關於項次15、16專案之「研究與發展計畫」。
三、台北高等行政法院則未說明OO國際股份有限公司所提相關證據之具體內容，並詳敘何以據該等證物內容仍無從勾稽屬項次15、16專案之支出或與投資抵減辦法第2條第1項所規定費用要件不合之具體理由。
◎ 相關法規
促進產業升級條列第八條之一免稅所得計算公式
重要投資事業五年免稅所得之計算：
一、獨立計算：
（一）屬新投資創立或增資擴展之重要投資事業，經核准免徵營利事業所
得稅者，其投資計畫完成後投資計畫之產品（勞務）如其帳冊簿據
設置完備，且其銷貨額、銷貨成本及毛利獨立計算，並嚴格合理分
攤管理費用及與該新投資創立或增資擴展新增之免稅所得有關之非
營業損益（註一）者，其新投資創立或增資擴展新增之免稅所得可
依其記載情形核實認定。
（二）所謂「銷貨額」「銷貨成本」可獨立計算者，係指計算免稅所得時
，其整廠之機器、設備、廠房及工程等（註三）屬經核准並完成投
資計畫設備清單內所載者，且其產品（勞務）全部屬投資計畫完成
後於核定之免稅期間內所生產（提供）者，或整架飛機或整艘船舶
而言，而其帳冊簿據與非屬投資計畫之產品（勞務）完全分開設立
記載，其相關銷貨成本可個別單獨認定。惟新投資創立或同一次增
資擴展投資計畫購置之廠房、飛機或船舶，其數量不止乙廠、乙架
或乙艘時，應將該新投資創立或該次增資擴展之各廠、各架或各艘
之所得合併計算。
二、不能獨立計算：
（一）新投資創立
1.全部產品（勞務）符合經核准並完成之投資計畫者
2.部分產品（勞務）符合經核准並完成之投資計畫者
3.部分產品（勞務）符合經核准並完成之投資計畫，機器、設備、
廠房及工程（註三）等非全部屬經核准並完成投資計畫之全新設
備清單所載者
4.部分產品（勞務）符合經核准並完成之投資計畫且部分委託加工
，機器、設備、廠房及工程（註三）等非全部屬經核准並完成投
資計畫之全新設備清單所載者
5.年度進行中免稅期間屆滿者
（二）增資擴展：
1.符合經核准並完成之投資計畫之產品（勞務），機器、設備、廠
房及工程等（註三）全部屬經核准並完成投資計畫之全新設備清
單所載者
2.符合經核准並完成之投資計畫之產品（勞務），機器、設備、廠
房及工程等（註三）非全部屬經核准並完成投資計畫之全新設備
清單所載者
3.符合經核准並完成之投資計畫之產品（勞務）部分委託加工，機
器、設備、廠房及工程等（註三）非全部屬經核准並完成投資計
畫之全新設備清單所載者
4.年度進行中免稅期間屆滿者